Institution
- Name: Prof. Dr. F. Böckler, Pharmazeutsiche Chemie, Department Pharmazie, Zentrum für Pharmaforschung, Ludwig-Maximilians-Universität München
- Address: Butenandtstraße 7, 81377 München
- Project Proposal Date: 2009-05-05
Abstract:
In meiner Doktorarbeit beschäftige ich mich mit der Entdeckung potentieller Inhibitoren für die Indolamine 2,3-dioxygenase (IDO) im Rahmen eines virtuellen High Throughput Screenings (vHTS). Die IDO ist ein immunmodulatorisches Enzym, das in bestimmten Krebszellen verstärkt exprimiert wird. Es steuert den Abbau der essentiellen Aminosäure L-Tryptophan ? über diesen Mechanismus kann Krebszellen Immuntoleranz verliehen werden. Die Entdeckung neuartiger IDO-Inhibitoren ist sehr wünschenswert. Für die Suche nach geeigneten Inhibitoren kommen eine Reihe computerunterstützter Methoden zum Einsatz, die teilweise einen hohen Rechenbedarf aufweisen. So sind für die Wirkstoffsuche aufwendige Docking-Berechnungen und Moleküldynamik-Simulation durchzuführen, deren rechenintensive Durchführungen am besten auf mehrere Computer zu verteilen sind. Die Nutzung des Rechen-Clusters würde für mich eine enorme Zeitersparnis bedeuten und mir die Möglichkeit bieten, Rechnungen durchzuführen, die auf einzelnen Rechnern gar nicht zu realisieren sind.