Institution
- Name: BioCenter Department II, Ludwig-Maximilians-Universität
- Address: Grosshaderner Str. 2, 82152 Planegg-Martinsried
- Project Proposal Date: 2009-04-06
Abstract:
Wir entwickeln Bayessche und Maximum-Likelihood-basierte Methoden zur Analyse positiver Selektion in divergierenden Populationen, die demographischen Prozessen unterliegen, insbesondere rezenter Artbildung, Introgression, Substruktur in den Populationen und zeitlichen Änderungen von Populationsgrößen. In unserem zweistufigen Verfahren untersuchen wir zunächst diese Prozesse anhand von Sequenzdaten von neutral evolvierenden Loci. Die Ergebnisse verwenden wir dann zur Analyse von Genen, die mit evolutionären Anpassungsprozessen in Verbindung gebracht werden. Dabei kombinieren wir neue Summary-Statistiken, die auf Frequenzspektren von Polymorphismen basieren, mit Markoffketten-Monte-Carlo-Techniken. Einige der verwendeten Summary-Statisitiken entwerfen wir speziell zur Unterscheidung zwischen positiv gerichteter und balancierender/diversifizierender Selektion. Wir untersuchen mit diesen Methoden Datensätze aus verschiedenen Projekten. Unser primäres Anwendungsbeispiel ist ein Datensatz von 17 Loci aus zwei Wildtomatenarten, die Flusstäler an den Westabhängen der Anden besiedeln. Dadurch sind beide Arten in geographisch isolierte Subpopulationen unterteilt. Dies könnte einerseits die Ausbreitung selektiv vorteilhafter Substitutionen behindern und andererseits lokale Anpassung erleichtern.